Os laboratórios de pesquisa estão localizados em sua grande maioria no Instituto Biomédico que fica no campus da UFF em Niterói (principal campus e sede da Universidade). Alguns docentes do programa estão lotados e possuem laboratórios de pesquisa no Instituto de Biologia, também localizado em Niterói, ou no Campi da UFF em Rio das Ostras (Campi fora da sede).
1- Laboratório de Fisiologia Endócrina e Metabolismo – Profa. Karen Oliveira, Bloco E do Instituto Biomédico
2- Laboratório de Neurofisiologia do Comportamento (LABNEC)– Profas Isabel David, Leticia de Oliveira e Mirtes Pereira, Bloco A do Instituto Biomédico.
3- Laboratório de Ciências do Exercício (LACE)– Profs. Antonio Claudio Nóbrega, Eliete Frantz e Natália Ayres, Bloco E do Instituto Biomédico.
4- Laboratório de Psicofisiologia Cognitiva (LPfC)– Profa. Izabela Mocaiber, Campi da UFF em Rio das Ostras.
5- Laboratório de Neurofarmacologia– Regina Kubrusly, Bloco E do Instituto Biomédico.
6- Laboratório de Farmacologia Experimental-Profas. Elisabeth Maróstica e Fernanda Brito, Bloco E do Instituto Biomédico.
7- Laboratório de Fisiologia do Exercício Experimental e Aplicada– Prof. Pedro Paulo Soares, Bloco E do Instituto Biomédico.
8- Laboratório de neurobiologia do comportamento animal– Prof. Pablo Pandolfo, Instituto de Biologia, Bloco M do Campus do Gragoatá.
9-Laboratório de Neurobiologia da Retina– Profa. Karin Calaza, Bloco M do Campus do Gragoatá.
10- Laboratório de Venenos e Toxinas de Animais e Avaliação de Inibidores (LAVENOTOXI), Prof. André Fuly, Instituto de Biologia, Bloco M do Campus do Gragoatá.
11- Laboratório de Biomarcadores Tumorais (LABMART), Profa. Etel Gimba, Campi da UFF em Rio das Ostras.
12- Laboratorio de Neuro-Oncobiologia, Profas Etel Gimba e Regina Kubrusly, Bloco A do Instituto Biomédico.
Laboratórios Multiusuários:
Laboratório Multiusuário de Fisiologia e Farmacologia (LAMFFA)
Laboratório Multiusuário de Fisiologia Integrativa (LAMFI)
Laboratório Multiusuário de Citometria de Fluxo (LMCF)